Общее направление процессов минералообразования на месторождении Ватиха фиксируется в виде: высокотемпературные метаморфические и магматические (с гранитными пегматитами) породы → скарны → грейзены → березиты → аргиллизиты. Аметисты связаны с процессами аргиллизации. На месторождении к настоящему времени известно 46 минералов.